ヘルパンギーナと同じような症状を示す疾患として、手足口病、ヘルペス性歯肉口内炎、アフタ性口内炎があります。表にヘルパンギーナの鑑別法として、他の疾患との相違点等について示しました。
口腔粘膜
1〜3mm程度の水疱から浅い潰瘍
口腔粘膜,四肢末端
2〜5mm程度の水疱から潰瘍
歯肉,頬粘膜
2〜10mm程度の斑から不定型の深い潰瘍
口腔全体
2〜5mm程度の深い潰瘍